Cysteaminehydrochloride kan worden gebruikt bij het maken van cosmetica, toevoegingsmiddelen voor diervoeders, geneesmiddelen tegen maagzweren, het kan ook worden toegepast bij het maken van biochemische reagens en complexe agentia van zware meatlionen. Het kan reageren met enzym van het menselijk lichaam en zijn prestaties stabiliseren wanneer straling bestaat, daarom kan het worden gebruikt bij het genezen van stralingssyndroom en het gif van tetraethyllood. Er kunnen tabletten of injecties van worden gemaakt.