L-cysteïne wordt voornamelijk gebruikt in de geneeskunde, cosmetica, biochemisch onderzoek; Gebruikt in broodmaterialen om de vorming van gluten te bevorderen en fermentatie, schimmel te bevorderen en veroudering te voorkomen. Gebruikt in natuurlijke sappen om de oxidatie van vitamine C te voorkomen en te voorkomen dat het sap bruin wordt. Het product heeft een ontgiftingseffect, kan worden gebruikt voor acrylonitrilvergiftiging, aromatische acidose.
Acetylcysteïne, ook bekend als N-acetylcysteïne of N-acetyl-L-cysteïne (NAC), is een medicijn dat wordt gebruikt om een overdosis te behandelen en om dik slijm los te maken, zoals bij cystische fibrose of chronische obstructieve longziekte.